Thomas Guyet

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Biographie

En parallèle d'un diplome d'ingénieur en informatique (ENSIMAG), j'ai obtenu en 2004 un DEA en Intelligence Artificiel. J'ai ensuite effectué une thèse aux laboratoires TIMC/PRETA et LIG/MAGMA. Je me suis alors intéressé à la collaboration Homme-Machine pour aider des experts à interpréter des données complexes. Ce travail était appliquée à des séries temporelles de patients en réanimation médicale. En 2007, j'ai intégré l'équipe IRISA/DREAM à Rennes pour travailler sur des méthodes de monitoring adaptatifs de flux de données.
Depuis février 2009, je suis maître de conférences à AGROCAMPUS OUEST. Ma recherche s'effectue au laboratoire d'informatique d'AGROCAMPUS OUEST, équipe associée à l'IRISA.

Je suis trésorier de l'AFIA et membre de l'ARCo.

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Domaines de recherche

• Fouille de données spatio-temporelles
  • Extraction d'informations à partir de séries temporelles et flux de données,
  • Extraction de motifs spatiaux (à partir d'une base de parcellaires)
  • Apprentissage de scénarios/chroniques à partir de séquences d'évènements,
• Monitoring et diagnostic en contexte changeant, adaptation,
• Apprentissage collaboratif, collaboration Homme-Machine,
• "Interprétation" et interprétation de données complexes.

Ces travaux sont appliqués, tant que faire ce peu, à des problématiques concrètes et, en particulier, à des problématiques agro-environnementales.

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Projets

• Projets en cours
  • PayTal (2011-2013) : Étude de l'étalement urbain par des méthodes d'analyse de séquences d'images.
  • PayOTe (2009-2012) : Paysage ou territoires. Caractérisation et simulation de paysages agricoles réalistes.
• Projets passés
  • SéSur : Sécurité et Surveillance dans les flots de données

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Enseignements

J'enseigne l'informatique dans une école d'agronomie qui comprend deux cursus : agro-alimentaire et ingénieur agronome.

Dans le cursus agro-alimentaire (L1 à L3). L'enseignement comprend une introduction à l'informatique (systèmes, réseaux et bureautique), une formation en base de données, et une introduction à la programmation en dernière année.

Dans le cursus ingénieurs Agronome, la formation en informatique se compose principalement des enseignements suivants :

• Bases de données (cf. page des enseignements C. Largouet),
• Langage C : introduction à la programmation, programmation C, interfacage C/R.
• Intelligence artificielle
  • Introduction à l'intelligence artificielle (niveau M1): introduction aux sciences cognitives, systèmes multi-agents, apprentissage automatique
  • Geographic (spatio-temporal) Knowledge Discovery (Niveau M2)
  • Reconnaissance de formes appliquée aux données géographiques (Niveau M2)

J'enseigne également dans une formation de niveau M2 (Master Géomatique/IMAGE co-habilité AGROCAMPUS OUEST/Rennes 2 et une spécialisation d'ingénieur Agronome GAPE) pourtant sur la geo-information. Pour plus d'infos sur cette formation, consulter le site de la formation http://geoinfo.agrocampus-ouest.fr/.

Finalement, à temps perdu, j'enseigne le GTKMM dans le module OCI du Master Génie Logiciel de l'ISTIC.

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Développements logiciel

Voici les principaux développements logiciels auxquels j'ai participé:

• LogStreamAnalyzer, 2008-... (C++) : outils adaptatif de détection d'intrusion dans des serveurs Web. Une première version interactive est axées vers l'exploration interactive de logs HTTP pour faciliter l'extraction et l'identification d'intrusions. Une version plus efficace (multithreadée, mais non-interactive) implémente un système de détection d'intrusions. A l'occasion de ce travail sur la détection d'intrusion, j'ai également développé différents outils d'anonymisation, de transformation et de visualisation des logs Apache. (Plus d'informations ...)
• Apprentissage incrémental interactif, 2009-... (JAVA) : à la suite du travail de R. Trepos et H.M Suchier je poursuis le développement d'un outil interactif d'extraction incrémentale de règles à partir des résultats d'un simulateur de diffusion des pesticides dans un bassin versant (SACADEAU).
• QTempIntMiner, 2008 (Matlab): implémentation d'un algorithme d'extraction de motifs temporels (dates et durées) à partir d'une longue séquence de symboles temporels. Fonctions Matlab et interface graphique (Plus d'informations ...).
• CATS, 2004-2007 (C++): outil interactif et collaboratif d'interprétation de séries temporelles multivariées (se référer à ma thèse)

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Publications

Télécharger toutes les références : [BibTeX], [DBLP], [HAL]

Journaux internationaux

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Knowledge construction from time series data using a collaborative exploration approach". Journal of Biomedical Informatics, Vol. 40 : p. 672–687. 2007.

Conférences et Workshops internationaux (avec comité de relecture)

Thomas Guyet and René Quiniou. "Extracting temporal patterns from interval-based sequences.". Proceedings of IJCAI : p. 1306-1311. 2011.

Wei Wang, Thomas Guyet and Svein Knapskog. "Autonomic Intrusion Detection System". Proceedings of the RAID : p. 2. 2009. (Poster)

Wei Wang, Florent Masseglia, Thomas Guyet, René Quiniou and Marie-Odile Cordier. "A General Framework for Adaptive and Online Detection of Web attacks (Poster)". Proceedings of the 18th international World Wide Web conference (WWW 2009) : p. 1141–1142. 2009. (Poster)

Wei Wang, Thomas Guyet, René Quiniou, Marie-Odile Cordier and Florent Masseglia. "Online and adaptive anomaly Detection: detecting intrusions in unlabelled audit data streams". Actes de la conférence Extraction et Gestion des Connaissances, EGC : p. 457–458. 2009.

Wei Wang, Sylvain Gombault and Thomas Guyet. "Towards fast detecting intrusions: using key attributes of network trafic". Proceedings of the third international conference on internet monitoring and protection (ICIMP) : p. 86–91. 2008. (Best Paper Award)

Thomas Guyet and René Quiniou. "Mining temporal patterns with quantitative intervals". The 4th International Workshop on Mining Complex Data, (IEEE ICDM) Workshop, Zighed, D. and Ras, Z. and Tsumoto, S. : p. 10. 2008.

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "A Human-Machine Cooperative Approach for Time Series Data Interpretation". Proceedings of the 11th Conference on Artificial Intelligence In Medicine, AIME'07, Springer-Verlag, Berlin, Bellazzi, R. and Abu-Hanna, A. and Hunter, J. : p. 3–12. 2007.

Thomas Guyet. "Annotation: a support for co-interpretation". Proceedings of the 4th International Conference in Enactive Interfaces, Enactive'07, Annie Luciani and Claude Cadoz : p. 113-116. 2007.

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Computer/Human Structural Coupling for Data Interpretation". Proceedings of ENACTIVE 2006: Third International Conference on Enactive Interfaces, Enaction and Complexity, Benoit Bardy and Denis Mottet. 2006.

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Human/Computer Interaction to Learn Scenarios from ICU Multivariate Time Series". AIME'05, 10th Conference on Artificial Intelligence in Medicine, Silvia Miksch and Jim Hunter and Elpida T. Keravnou : p. 424–428. 2005.

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Partenariat Utilisateur-SMA pour l'Apprentissage à Partir de Séries Temporelles, Application au Monitoring en Soins Intensifs". Proceeding of JFSMA: Journée Francophone des Systèmes Multi Agents, Vers la Conception de Système Artificiels Socio-Mimétiques, Hermes Science, Alexis Drogoul and Eric Ramat : p. 15–18. 2005.

Conférences et Workshops nationaux (avec comité de relecture)

Thomas Guyet and René Quiniou. "Incremental mining of frequent sequences from a window sliding over a stream of itemsets.". Journée Intelligence Artificielle Fondamentale (IAF) : p. 9. 2012.

Thomas Guyet and René Quiniou. "Extraction incrémentale de séquences fréquentes dans un flux d'itemsets.". Extraction et Gestion de Connaissances EGC'12, Bruno Pinaud and Guy Melan\c con and Yves Lechevallier : p. . 2012.

Thomas Guyet, Hervé Nicolas and Abdou Diouck. "Segmentation multi-échelle de séries temporelles d'images satellite : Application à l'étude d'une période de sécheresse au Sénégal.". Actes de la conférence RFIA : p. . 2012.

Thomas Guyet and René Quiniou. "Extraction de motifs temporels à partir de séquences d'événements avec intervalles temporels.". Extraction et Gestion de Connaissances EGC'11, P. Poncelet : p. 23–34. 2011.

Thomas Guyet. "Fouille de données spatiales pour la caractérisation spatiale de paysages en lien avec des fonctionnalités agro-écologiques". Spatial Analysis and GEOmatics (SAGEO'10) : p. 3. 2010. (Poster)

Thomas Guyet, René Quiniou and Marie-Odile Cordier. "LogAnalyzer : monitoring adaptatif d'un flux de données". Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA'10) : p. 2. 2010. (Demo)

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Interprétation collaborative de séries temporelles". Actes du Colloque de l'Association pour la Recherche Cognitive (ARCo'09) : p. 10. 2009.

Marie-Odile Cordier, Thomas Guyet, Christine Largouet, Véronique Masson and Henri-Maxime Suchier. "Apprentissage incrémental de règles de décision à partir de données d'un simulateur". Atelier Systèmes d'Information et de Décision pour l'Environnement : p. 6. 2009.

Thomas Guyet, Wei Wang, René Quiniou and Marie-Odile Cordier. "Diagnostic multi-sources adaptatif. Application à la détection d'intrusion dans des serveurs Web". Actes de la conférence Extraction et Gestion des Connaissances, EGC : p. 325–336. 2009. (Candidat to the Best Application Paper Award)

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Algorithme d'Apprentissage de Scénarios à partir de Séries Symboliques Temporelles". Atelier Fouille de Données Temporelles, EGC'06 : Extraction et Gestion de Connaissances, René Quiniou and Georges Hébrail. 2006.

Thomas Guyet, Catherine Garbay and Michel Dojat. "Apprentissage de Scénarios à Partir de Séries Temporelles Multivariées". Actes des Cinquièmes Journées Extraction et Gestion des Connaissances EGC'05, Cépaduès-Éditions, Pinson, S. and Vincent, N., Revue des Nouvelles Technologies de l'Information : p. 133. 2005.

Thèse

Thomas Guyet. "Interprétation collaborative de séries temporelles. Application à des données de réanimation médicale". PhD thesis, INPG. 2007.

Thomas Guyet. "Extraction d'information en anesthésie réanimation. Apprentissage de scénarios dans des séries temporelles". Master thesis, UJF Grenoble. 2004.

Autres productions

Thomas Guyet and Marie-Odile Cordier (Edt). "Intelligence Artificielle et Agronomie". Dossier spécial du bulletin de l'AFIA (Association Française pour l'Intelligence Artificielle) 2012.

Thomas Guyet. "Aide à l'interprétation de séries temporelles. Approche Enactive de la construction de sens". Enaction et Constructivism Summer School 2006.

Thomas Guyet, René Quiniou, Wei Wang and Marie-Odile Cordier. Technical report:RR-6989:"Self-adaptive web intrusion detection system". INRIA 2009.

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